Hea Algus alustas tegevust 1994. aastal Avatud Eesti Fondi algatusel ja toel lasteaedade arendusprogrammina, mille eesmärgiks on lapsekeskse metoodika levitamine Eestis.
- 1996. aastal laienes Hea Algus üle Eesti algklassidesse. Samal aastal registreeriti iseseisev mittetulundusühing Hea Algus
- 1997. aastal alustas tegevust Hea Alguse Pereprogramm, mis on suunatud väikelastega peredele
- 2000. aastal asutasime ühingu juurde ametliku Hea Alguse Koolituskeskuse, mis pakub täiendkoolitust lasteaia- ja kooliõpetajatele (koolitusluba 6317 HTM)
Hea Alguse missiooniks on õpetajate professionaalse arengu ning lapsevanematega koostöö kaudu võrdsete hariduslike võimaluste loomine kõigile eesti lastele toetudes lapsekesksele kasvatusele ja demokraatia põhimõtetele.

September 2010.a. – mai 2011.a. viis MTÜ Hea Algus ESF Programmi `Üldhariduse pedagoogide kvalifikatsiooni tõstmine 2008-2014` raames läbi võrgustikuprojekti, mille eesmärgiks on õpetajate vahelise võrgustikupõhise koostöö aktiviseerumine.